L’action opérationnelle du Ministère est structurée autour de trois Directions Générales principales, chacune spécialisée dans un segment clé du mandat ministériel.
1. Direction Générale de l'Environnement (DGE)
La DGE est l'organe d'application et de contrôle des lois environnementales. Elle se compose de :
- Direction de la prévention des pollutions et des nuisances
- Direction du droit et de l'éducation environnementale
- Direction administrative et financière
- Direction de la conservation des écosystèmes naturels
2. Direction Générale du Développement Durable (DGDD)
La DGDD impulse la transition écologique et l'intégration des Objectifs de Développement Durable (ODD). Elle se compose de :
- Direction de l'écologie et des ressources naturelles
- Direction des normes sectorielles
- Direction de la promotion des valeurs socio-économiques
- Direction administrative et financière
3. Direction Générale du Bassin du Congo (DGBC)
La DGBC gère la politique stratégique liée au fleuve et à son écosystème forestier. Elle se compose de :
- Direction de la réglementation et du contentieux
- Direction des études, de la protection et de la valorisation
- Direction administrative et financière